ניתן לסווג מכונות שתילים לשלושה סוגים על סמך רמת האוטומציה שלהן: ידניות, חצי-אוטומטיות ואוטומטיות לחלוטין. מכונות ידניות כוללות עיצוב פשוט ומסתמכות בעיקר על עבודה אנושית למשימות כגון מילוי מצע, הנחת זרעים וכיסוי אדמה; בעוד שהם חסכוניים-ומתאימים לפעילות-בקנה מידה קטן או ביתי-, היעילות שלהם מוגבלת.
מכונות חצי-אוטומטיות מכניות שלבים ספציפיים של התהליך-כגון מילוי מצע, טבילה (יצירת חורי שתילה) או זריעה-עם זאת עדיין דורשות התערבות ידנית למשימות כמו טעינה ופריקה של מגשים או מילוי חומרים. בשימוש נרחב במשתלות שתילים קטנות-עד-בינוניות-, מכונות אלו מייצרות איזון נוח בין יעילות לעלות.
מכונות אוטומטיות לחלוטין משלבות את כל זרימת העבודה-כולל אספקת מצע, זריעה אוטומטית, כיסוי אדמה, השקיה ופריקה של מגש-מה שמאפשרים פעולה כמעט בלתי מאוישת. מכונות אלו מועסקות בדרך כלל במרכזי שתילים חקלאיים בקנה מידה- גדול (כגון מתקני שתילי ירקות תעשייתיים), ומציעות יעילות גבוהה כמו גם דיוק ועקביות זריעה מעולים, אם כי הן כרוכות בעלויות השקעה ראשוניות ותחזוקה גבוהות יותר.
